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赋能手艺提升 解码病原密码——国家生物信息中心联合广东省疾病预防控制中心举行“病原微生物基因组测序手艺及数据剖析”钻研培训

为应对病原微生物快速变异带来的公共卫生挑战 ,提升我国疾病预防控制领域新一代基因测序手艺的应用水平 ,国家生物信息中心联合广东省疾病预防控制中心(国家基因组科学数据中心—病原微生物分中心)、广东省预防医学会病原分子诊断和分子盛行病专业委员会、中国医药教育协会医学基因组学与生物信息学专委会 ,于6月25日至27日在广州举行了“病原微生物基因组测序手艺及数据剖析”专题钻研培训。本次培训吸引了来自科研院所、医院、广东省疾控系统近60名专业职员 ,配合聚焦病原基因组学手艺前沿 ,提升病原微生物相关的基因组测序手艺和数据剖析能力。

培训最先 ,广东省疾病控制中心病原微生物磨练所所长李柏生致辞 ,他体现 ,高通量测序手艺作为目今最前沿的病原微生物检测手段 ,为病原体快速精准判断和熏染病疫情实时监测提供了强有力的手艺支持。为提升疾病预防控制领域专业职员的基因组测序和剖析能力 ,加速高通量测序手艺在病原体检测与溯源中的普遍应用 ,国家生物信息中心携手广东省疾病预防控制中心 ,配合组织了本次培训 ,希望学员都有所收获。

国家生物信息中心陈非研究员以《高致病微生物及熏染性疾病基因组学研究范式》为题授课。他从肺结核病的研究入手 ,围绕体检大数据表型组学研究、基因组盛行病学研究、多维组学宿主熏染机制研究三方面举行了教学。李翠丹副研究员先容了细菌基因组盛行病学剖析及在肺炎克雷伯菌(肺克)中的应用 ,她从细菌基因组剖析的流程和履历、高耐药肺克剖析应用、高毒力肺克剖析应用、高毒高耐肺克剖析应用四个方面 ,针对细菌基因组剖析历程中遇到的问题息争决计划举行了先容。宋述慧研究员系统先容了国家生物信息中心数据资源系统、病原综合信息库及快速剖析与展望预警模子。李论助理研究员对基于系统发育树、单体型网络演化和序列相似性的病原溯源 ,MEGA实训实习等在病毒溯源历程中常用的要领和问题举行了先容。

中山大学施莽教授以《基于全熏染组的病原体检测》为题授课 ,系统先容了呼吸道全熏染组、前言全熏染组、动物全熏染组的病原体检测剖析要领 ,并先容了基于全熏染组的生态学研究要领。广东省公共卫生研究院刘哲副主任技师先容了宏基因组测序在疾控事情中的应用 ,从宏基因组测序样品制备、宏基因组测序数据剖析和细菌宏基因组样本制备三方面 ,对病毒、细菌基因组样本制备的原理、要领和问题举行了教学。

广东省疾病控制中心张昌副主任技师向导学员举行了病原微生物高通量测序数据剖析在外地云平台的实操。实操内容主要包括基因组组装、基因特征剖析、溯源剖析和宏基因组测序病原体判断等。国家生物信息中心高级工程师王彦青系统先容了国家生物信息中心原始数据与基因组数据汇交系统 ,解答了学员在汇交中遇到的问题 ,并网络了学员关于相关系统的意见和建议。

本次培训笼罩疾控从业者、临床磨练与熏染病防治职员、基因检测手艺职员等。通过本次理论培训和现场实操 ,资助专业职员掌握了基因组测序手艺的最新生长趋势 ,提升了学员数据剖析与现实应用能力。

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培训现场


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